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Caracterización del gen CXCR4 bovino y su promotor: filogenia en la tribu bovini, detección de selección y asociación con la tripanotolerancia

Dr. Félix Mª Goyache Goñi. (2011-2014)

El proyecto pretende la re-secuenciación del receptor de la quimiocina CXC tipo 4 –CXCR4- relacionado con la inmunidad y “fitness” para:

a) establecer los patrones evolutivos y los efectos de selección de este gen, comparando muestras de Bos taurus europeo y africano con ganado cebuino (B. indicus) y otros miembros de la Tribu Bovini, incluyendo gaur -B. frontalis-

b) establecer relaciones de asociación entre los polimorfismos encontrados con la estrongilosis y la tripanotolerancia.

Para ello, se contará con muestras no experimentales de ganado africano fenotipadas para la presencia de tripanosomas en sangre. Se aplicarán tecnologías de captura de secuencias en ‘arrrays’ de fase líquida y posterior análisis de las secuencias mediante secuenciadores de alto rendimiento. Esta tecnología, que permite una re-secuenciación simultánea y económica de varios miles de pares de bases del genoma, está indicada en aplicaciones finalistas para la detección de mutaciones en regiones concretas del genoma más que en el genoma completo.

Resultados Preliminares

Resultado preliminar del año 2012.
Resultado preliminar del año 2013.
Resultado preliminar del año 2014.


Ficha del Proyecto
TítuloCaracterización del gen CXCR4 bovino y su promotor: filogenia en la tribu bovini, detección de selección y asociación con la tripanotolerancia
CódigoAGL2011-27585
Área

Genética y Reproducción Animal.

CoordinadorDr. Félix Mª Goyache Goñi
Equipo InvestigadorFélix Mª Goyache Goñi. SERIDA
Isabel Álvarez Fernández. SERIDA
Albano Beja-Pereira. CIBIO Universidade do Porto
Shanyuan Chen. CIBIO Universidade do Porto
Amadou Traoré INERA
Hamidou H. Tamboura INERA
Equipo TécnicoIván Fernández Suárez. SERIDA
FinanciaMinisterio de Ciencia e Innovación
ColaboraConference des Responsables de Recherche Agronomique Africains / West and Central African Council for Agricultural Research and Development (CORAF/WECARD).
Periodo2011-2014
EstadoNo vigente
Cantidad121000€