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Memoria SERIDA 2011

Resultado Proyecto

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Secuenciación del genoma y del transcriptoma de Phaseolus vulgaris

Referencia: EUI2009-04052. Organismo financiador: Ministerio de Ciencia e Innovación. Importe: 10.000 €. Duración: 2010-2012.

Equipo investigador

Marta Santalla Ferradas. (Coordinadora del proyecto) MBG-CSIC
Juan José Ferreira Fernández. (Coordinador por el SERIDA) SERIDA
Ana Campa Negrillo. SERIDA

Entidades Colaboradoras

Misión Biológica de Galicia (MBG-CSIC)
Instituto de Agricultura Sostenible-CSIC
Universidad de León
Life Sequencing S.L.
Centro de Investigación Agrogenómica CSIC-IRTA-UAB
Centro de Regulación Genómica

Justificación

El objetivo de este proyecto es la secuenciación, ensamblaje y anotación del genoma de judía común (Phaseolus vulgaris L.) y, en una segunda fase, la secuenciación y análisis del transcriptoma obtenido bajo diferentes condiciones estresantes o estados de desarrollo de la planta. El genotipo que se pretende secuenciar es BAT93, una línea clasificada dentro del grupo de germoplasma mesoamericano. Para el desarrollo de este objetivo se ha constituido un consorcio internacional, promovido por el Programa Iberoamericano de Ciencia y Tecnología para el Desarrollo (CYTED), e integrado por los siguientes países: Argentina, Brasil, España y México.

Objetivo

Los objetivos concretos que desarrollará el SERIDA son:

Contribuir a la secuenciación del transcriptoma de BAT93 para la respuesta a Colletotrichum lindemuthianum (Sacc. & Magn.) Scrib. (10 raza diferentes) y oidio (un aislamiento).

Análisis del control genético de la resistencia a antracnosis en BAT93 para integrar los datos genéticos y genómicos.
Ayudar a la re-secuenciación del genoma de una línea de faba granja asturiana

Se iniciaron los trabajos para el aislamiento del ARN en la línea BAT93 en condiciones de inoculación a diferentes razas de antracnosis.

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