Resultado Proyecto
Caracterización del gen CXCR4 bovino y su promotor: filogenia en la tribu bovini, detección de selección y asociación con la tripanotolerancia
Referencia: AGL2011-27585. Organismo financiador: Ministerio de Ciencia e Innovación. Importe: 121.000 €. Duración: 2011-2014.
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Equipo investigador
Félix Mª Goyache Goñi. SERIDA
Isabel Álvarez Fernández. SERIDA
Albano Beja-Pereira. CIBIO Universidade do Porto
Shanyuan Chen. CIBIO Universidade do Porto
Amadou Traoré INERA
Hamidou H. Tamboura INERA
Equipo técnico
Iván Fernández Suárez. SERIDA
Entidad Colaboradora
Conference des Responsables de Recherche Agronomique Africains / West and Central African Council for Agricultural Research and Development (CORAF/WECARD).
Justificación
El proyecto pretende la re-secuenciación del receptor de la quimiocina CXC tipo 4 –CXCR4- relacionado con la inmunidad y “fitness” para:
a) establecer los patrones evolutivos y los efectos de selección de este gen, comparando muestras de Bos taurus europeo y africano con ganado cebuino (B. indicus) y otros miembros de la Tribu Bovini, incluyendo gaur -B. frontalis-
b) establecer relaciones de asociación entre los polimorfismos encontrados con la estrongilosis y la tripanotolerancia.
Para ello, se contará con muestras no experimentales de ganado africano fenotipadas para la presencia de tripanosomas en sangre. Se aplicarán tecnologías de captura de secuencias en ‘arrrays’ de fase líquida y posterior análisis de las secuencias mediante secuenciadores de alto rendimiento. Esta tecnología, que permite una re-secuenciación simultánea y económica de varios miles de pares de bases del genoma, está indicada en aplicaciones finalistas para la detección de mutaciones en regiones concretas del genoma más que en el genoma completo.