Resultado Proyecto
Caracterización del gen CXCR4 bovino y su promotor: filogenia en la tribu bovini, detección de selección y asociación con la tripanotolerancia
Referencia: AGL2011-27585. Organismo financiador: Ministerio de Ciencia e Innovación. Importe: 121.000 €. Duración: 2011-2014.
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Equipo investigador
Félix Mª Goyache Goñi. SERIDA
Isabel Álvarez Fernández. SERIDA
Albano Beja-Pereira. CIBIO Universidade do Porto
Shanyuan Chen. CIBIO Universidade do Porto
Amadou Traoré INERA
Hamidou H. Tamboura INERA
Equipo técnico
Iván Fernández Suárez. SERIDA
Entidad Colaboradora
Conference des Responsables de Recherche Agronomique Africains / West and Central African Council for Agricultural Research and Development (CORAF/WECARD).
Avance de resultados
Se han analizado un total de 8994 pares de bases (pb) correspondientes a zonas exónicas (codificantes de proteínas) e intrónicas (no codificantes) de los genes CXCR4, TICAM1 e INHBA, de los que existe evidencia científica previa de su relación con la tripanotolerancia bovina, en 96 muestras bovinas, incluyendo bovino europeo, africano tripanotolerante, africano tripanosusceptible y cebú africano y asiático, así como otros miembros de la Tribu bovini: Bos frontalis (gaur), Bos grunniens (yak), Bison bonasus (bisonte europeo), Bison bison (bisonte americano), Syncerus caffer (búfalo rojo), Connochaetes taurinus (Ñu), Ovis aries (oveja), y h) Capra hircus.
En la Tabla 1 adjunta se detalla el número de mutaciones encontradas en los exones de los genes analizados. Se considera que las regiones analizadas presentan un alto grado de conservación entre especies. A pesar de haber incluido en el análisis muestras de especies cuya evolución se separó hace más de 20 millones de años la proporción de mutaciones encontradas varía entre el 0% (Exón 1 del gene CXCR4) y el 1,9% (Exón 1 del gen TICAM1 y Exón 2 del gen INHBA). Este hecho sugiere la presencia de una intensa selección depurativa en la secuencias codificantes de los genes estudiados, lo que indicaría cierta importancia en la respuesta inmunitaria. La variación genética encontrada puede resultar útil para alcanzar los objetivos del proyecto.
Tabla 1. Número de mutaciones (SNP) encontradas en los exones de tres genes de importancia inmunitaria relacionados con la tripanotolerancia bovina.
| Gen | CXCR4 | TICAM1 | INHBA |
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| Exon 1 | Exon 2 | Exon 1 | Exon 2 | Exon 1 | Exon 2 |
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| Tamaño (pb) | 103 | 1570 | 1122 | 1158 | 665 | 985 |
| Número de SNP | 0 | 24 | 21 | 15 | 9 | 19 |
pb: pares de bases.