Resultado Proyecto

Caracterización del gen CXCR4 bovino y su promotor: filogenia en la tribu bovini, detección de selección y asociación con la tripanotolerancia

Referencia: AGL2011-27585. Organismo financiador: Ministerio de Ciencia e Innovación. Importe: 121.000 €. Duración: 2011-2014.

Equipo investigador

Félix Mª Goyache Goñi. SERIDA
Isabel Álvarez Fernández. SERIDA
Albano Beja-Pereira. CIBIO Universidade do Porto
Shanyuan Chen. CIBIO Universidade do Porto
Amadou Traoré INERA
Hamidou H. Tamboura INERA

Equipo técnico

Iván Fernández Suárez. SERIDA

Entidad Colaboradora

Conference des Responsables de Recherche Agronomique Africains / West and Central African Council for Agricultural Research and Development (CORAF/WECARD).

Avance de resultados

Resumen

El proyecto contemplaba la secuenciación del gen CXCR4 bovino en unos centenares de muestras bovinas y otros miembros de la Tribu bovini. Como variación en la estrategia prevista para el desarrollo del proyecto, se ha identificado un conjunto selecto de muestras que debe incluir la mayor parte de la variabilidad genética relevante en las regiones genómicas de interés. La variabilidad genética identificada se diagnosticaría, posteriormente, mediante técnicas clásicas Sanger en los centenares de muestras inicialmente previstos. El conjunto de esos 96 animales seleccionados incluye: a) Bovino (Bos taurus) europeo (tripanosusceptible): 13 muestras de 13 razas diferentes; b) Bovino (B. taurus) africano (tripanotolerante): 24 muestras de raza N’Dama y Baoulé-Lobi; c) Bovino (B. taurus) africano (tripanosusceptible): 4 muestras de las razas Africaner y Bonsmara; d) Cebú (B. indicus) africano: 15 muestras de las razas Bororo, Azawak, Goudali, Peul, Boran, Nguni y Ankole; f) Cebú (B. indicus) asiático: 5 muestras de las razas Gyr, Nelore y Brahman; g) Otros representantes de la Tribu Bovini: 11 muestras de las especies Bos frontalis (gaur), Bos grunniens (yak), Bison bonasus (bisonte europeo), Bison bison (bisonte americano), Syncerus caffer (búfalo rojo); Connochaetes taurinus (Ñu); h) Ovis aries; y h) Capra hircus. Tanto de oveja como de cabra se incluyeron muestras de razas tripanotolerantes y tripanoresistentes.

Esta nueva estrategia permite mejoras de tipo científico que consisten, fundamentalmente, en la posibilidad de analizar, además de los 3741 pares de bases (pb) del gen CXCR4 bovino (Dayo et al., 2009, Molecular Ecology 18, 1801–1813), los siguientes genes: a) exón 8 del gen ARHGAP15 bovino (122pb) que incluye una mutación no sinónima en posición 53317501 con cambio aminoacídico H/P de posible interés (Noyes et al., 2011, PNAS 108, 9304-9309); b) gen TICAM1 bovino (2280pb), cuyo interés también ha sido señalado por Noyes et al. (2011, PNAS 108, 9304-9309); y c) gen INHBA bovino (1650pb) cuya importancia en el ámbito del proyecto se ha propuesto recientemente (Dayo et al., 2012, Animal Genetics, 43, 123–132).

La colaboración del equipo investigador y la empresa LifeSequencing S.L. ha permitido el diseño de una panel de cebadores específicos y su test en una muestra patrón de Frisón Europeo para la consecución de los objetivos previstos.